L’eau intervient dans les cycles biogéochimiques à plusieurs échelles spatiales, avec des effets contrastés sur la dynamique des matières organiques du sol (MOS).
A l’échelle des plantes, la disponibilité en l'eau influence les processus biologiques, tels que la croissance racinaire, l’assimilation ou l’exsudation, modulant les apports de MO vers le sol. Cependant, les processus de décomposition et de stabilisation des MOS se produisent à l'échelle microscopique, où les variations de teneur en eau influencent la cooccurrence de la MOS et des micro-organismes.